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hal-01104015v1  Chapitre d'ouvrage
Evguenia KopylovaLaurent NoéCorinne da SilvaJean-Frédéric BerthelotAdriana A. Alberti et al.  Deciphering metatranscriptomic data
Methods in Molecular Biology, 1269, Springer, pp.279-291, 2015, RNA Bioinformatics, 978-1-4939-2290-1. ⟨10.1007/978-1-4939-2291-8_17⟩
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tel-00919185v2  Thèse
Evguenia Kopylova. New algorithmic and bioinformatic approaches for the analysis of data from high throughput sequencing
Bioinformatics [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2013. English
hal-00763792v1  Communication dans un congrès
Evguenia KopylovaLaurent NoéHelene Touzet. SortMeRNA: a new software to filter total RNA for metatranscriptomic or RNA analysis
JOBIM - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - 2012, Jul 2012, Rennes, France
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hal-00756249v1  Article dans une revue
Azadeh SaffarianMathieu GiraudAntoine de MonteHélène Touzet. RNA Locally Optimal Secondary Structures
Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2012, 19 (10), pp.1120-1133. ⟨10.1089/cmb.2010.0178⟩
hal-00958207v1  Article dans une revue
Martin FrithLaurent Noé. Improved search heuristics find 20 000 new alignments between human and mouse genomes.
Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2014, 42 (7), pp.e59. ⟨10.1093/nar/gku104⟩
inria-00609791v1  Communication dans un congrès
Anna GambinSlawomir LasotaMichal StartekMaciej SykulskiLaurent Noé et al.  Subset seed extension to Protein BLAST
Bioinformatics 2011 - International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, Jan 2011, Rome, Italy. pp.149-158, ⟨10.5220/0003147601490158⟩
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lirmm-00757983v1  Article dans une revue
Nicolas PhilippeMikael SalsonThierry LecroqMartine LéonardThérèse Commes et al.  Read indexing
EMBnet.journal, EMBnet, 2011, 17 (Supplement B), pp.1. ⟨10.14806/ej.17.B.289⟩
hal-01396904v1  Article dans une revue
Kristoffer SahlinRayan ChikhiLars Arvestad. Assembly scaffolding with PE-contaminated mate-pair libraries
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2016, 32 (13), pp.1925 - 1932. ⟨10.1093/bioinformatics/btw064⟩
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hal-01574824v1  Poster
Pierre MarijonJean-Stéphane VarréRayan Chikhi. Debugging long-read genome and metagenome assemblies using string graph analysis
JOBIM 2017- Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France
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hal-01753402v1  Communication dans un congrès
Philippe MarquetMaude Pupinyann Secq. L codent, L créent: créations numériques artistiques pour démystifier l'informatique... au féminin! (descriptif d’atelier)
Didapro 7 – DidaSTIC. De 0 à 1 ou l’heure de l’informatique à l’école, Feb 2018, Lausanne, Suisse. pp.1-2
hal-01516289v1  Article dans une revue
Anton W LangerakMonika BrüggemannFrédéric DaviNikos DarzentasJacques J M van Dongen et al.  High-Throughput Immunogenetics for Clinical and Research Applications in Immunohematology: Potential and Challenges.
Journal of Immunology, Publisher : Baltimore : Williams & Wilkins, c1950-. Latest Publisher : Bethesda, MD : American Association of Immunologists, 2017, pp.1602050. ⟨10.4049/jimmunol.1602050⟩
hal-00749016v1  Article dans une revue
Michal StartekSlawomir LasotaMaciej SykulskiAdam BulakLaurent Noé et al.  Efficient alternatives to PSI-BLAST
Bulletin of the Polish Academy of Sciences: Technical Sciences, Polish Academy of Sciences, 2012, 60 (3), pp.495-505. ⟨10.2478/v10175-012-0063-0⟩
inria-00527029v1  Article dans une revue
Laurent NoéMarta GîrdeaGregory Kucherov. Designing Efficient Spaced Seeds for SOLiD Read Mapping.
Advances in Bioinformatics, Hindawi Publishing Corporation, 2010, ⟨10.1155/2010/708501⟩
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inria-00448741v1  Communication dans un congrès
Marta L. GîrdeaLaurent NoéGregory Kucherov. Back-translation for discovering distant protein homologies
the 9th International Workshop in Algorithms in Bioinformatics (WABI), Sep 2009, Philadelphia, United States. pp.108-120, ⟨10.1007/978-3-642-04241-6_10⟩
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tel-00832725v1  Thèse
Aude Liefooghe. Matrices score-position, algorithmes et propriétés
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2008. Français
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tel-00832700v1  Thèse
Azadeh Saffarian. Prediction and pattern matching algorithms for RNA multi-structures
Data Structures and Algorithms [cs.DS]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2011. English
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tel-00832663v1  Thèse
Tuan Tu Tran. Bioinformatics Sequence Comparisons on Manycore Processors
Data Structures and Algorithms [cs.DS]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2012. English
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tel-00832685v1  HDR
Jean-Stéphane Varré. Algorithmes pour la comparaison de génomes et la recherche de signaux cis-régulateurs
Bio-informatique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2008