CRISTAL-BONSAI collection |
![]() |
|
||
---|---|---|
hal-00623404v1
Article dans une revue
Parallel Position Weight Matrices Algorithms Parallel Computing, Elsevier, 2011, 37, pp.466-478. ⟨10.1016/j.parco.2010.10.001⟩ |
||
inria-00623390v1
Communication dans un congrès
Biomanycores, open-source parallel code for many-core bioinformatics Bioinformatics Open Source Conference (BOSC 2011), 2011, Vienne, Austria |
||
tel-00401991v2
Thèse
Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants Bio-informatique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2009. Français |
||
lirmm-00757979v1
Article dans une revue
A combinatorial and integrated method to analyse RNA-seq reads EMBnet.journal, EMBnet, 2011, 17 (Supplement B), pp.1. ⟨10.14806/ej.17.B.290⟩ |
||
hal-00563408v1
Chapitre d'ouvrage
Manycore high-performance computing in bioinformatics Laura Elnitski, Helen Piontkivska, Lonnie R Welch. Advances in Genomic Sequence Analysis and Pattern Discovery, World Scientific, chapter 8, 2011 |
||
hal-02435116v1
Communication dans un congrès
CONSENT: Scalable self-correction of long reads with multiple sequence alignment Recomb-Seq 2019 - 9th RECOMB Satellite Workshop on Massively Parallel Sequencing, May 2019, Washinton, United States. pp.1-9, ⟨10.1101/546630⟩ |
||
hal-02167175v1
Article dans une revue
Graph analysis of fragmented long-read bacterial genome assemblies Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, ⟨10.1093/bioinformatics/btz219⟩ ![]() |
||
hal-02407243v1
Article dans une revue
Toward perfect reads: self-correction of short reads via mapping on de Bruijn graphs Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, ⟨10.1093/bioinformatics/btz102⟩ |
||
tel-00833144v1
Thèse
Évolution des génomes mitochondriaux de plantes : approche de génomique comparative chez Zea mays et Beta vulgaris Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2010. Français |
||
hal-01937890v1
Article dans une revue
Bioinformatics tools for the discovery of new lipopeptides with biocontrol applications European Journal of Plant Pathology, Springer Verlag, 2018, ⟨10.1007/s10658-018-1544-2⟩ ![]() |
||
hal-01575755v1
Article dans une revue
Assessment of Common and Emerging Bioinformatics Pipelines for Targeted Metagenomics PLoS ONE, Public Library of Science, 2017, 12 (1), pp.e0169563. ⟨10.1371/journal.pone.0169563⟩ |
||
hal-01395704v1
Article dans une revue
Compacting de Bruijn graphs from sequencing data quickly and in low memory Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2016, 32 (12), pp.i201 - i208. ⟨10.1093/bioinformatics/btw279⟩ ![]() |
||
tel-01577763v1
HDR
Compter les globules blancs, analyser les partitions Informatique [cs]. Université de Lille 1 – Sciences et Technologies, 2016 |
||
tel-00918918v1
HDR
Modèles bio-informatiques pour les peptides non-ribosomiques et leurs synthétases Bio-informatique [q-bio.QM]. Université des Sciences et Technologie de Lille - Lille I, 2013 |
||
hal-01100152v1
Communication dans un congrès
Diagnostic et suivi des leucémies aiguës lymphoblastiques (LAL) par séquençage haut-débit (HTS) Congrès de la Société Française d'Hématologie (SFH), 2014, Paris, France |
||
hal-01279160v1
Article dans une revue
Multi-loci diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia with high-throughput sequencing and bioinformatics analysis British Journal of Haematology, Wiley, 2016, 173 (3), pp.413-420. ⟨10.1111/bjh.13981⟩ |
||
hal-03107529v2
Article dans une revue
TgAP2IX-5 is a key transcriptional regulator of the asexual cell cycle division in Toxoplasma gondii Nature Communications, Nature Publishing Group, 2021, 12, pp.116. ⟨10.1038/s41467-020-20216-x⟩ |
||
hal-03081813v1
Article dans une revue
Monomer structure fingerprints: an extension of the monomer composition version for peptide databases Journal of Computer-Aided Molecular Design, Springer Verlag, 2020, 34 (11), pp.1147-1156. ⟨10.1007/s10822-020-00336-8⟩ |
||
hal-00823594v1
Article dans une revue
MAGNOLIA: multiple alignment of protein-coding and structural RNA sequences. Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2008, 36 (Web Server issue), pp.W14-8. ⟨10.1093/nar/gkn321⟩ |
||
hal-02394395v1
Article dans une revue
Comparative assessment of long-read error correction software applied to Nanopore RNA-sequencing data Briefings in Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2019, pp.1-18. ⟨10.1093/bib/bbz058⟩ |
||
hal-01390478v1
Article dans une revue
Computational pan-genomics: status, promises and challenges Briefings in Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2018, 19 (1), pp.118-135. ⟨10.1093/bib/bbw089⟩ |
||
hal-01228130v1
Article dans une revue
Modeling alternate RNA structures in genomic sequences. Journal of Computational Biology, Mary Ann Liebert, 2015, 22 (3), pp.190-204 |
||
hal-01396410v1
Article dans une revue
Assisted transcriptome reconstruction and splicing orthology BMC Genomics, BioMed Central, 2016, Proceedings of the 14th Annual Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Comparative Genomics Satellite Workshop: genomics, 17 (Suppl 10), pp.786. ⟨10.1186/s12864-016-3103-6⟩ |
||
hal-01574630v1
Communication dans un congrès
DiNAMO: Exact method for degenerate IUPAC motifs discovery, characterization of sequence-specific errors JOBIM 2017 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2017, Lille, France |
||
hal-01083841v1
Communication dans un congrès
ProCARs: Progressive Reconstruction of Ancestral Gene Orders ISCB-Latin America, Oct 2014, Belo Horizonte, Brazil |
||
hal-01646297v1
Article dans une revue
MATAM: reconstruction of phylogenetic marker genes from short sequencing reads in metagenomes Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2017, ⟨10.1093/bioinformatics/btx644⟩ |
||
hal-00647725v1
Article dans une revue
BRASERO: A resource for benchmarking RNA secondary structure comparison algorithms Advances in Bioinformatics, Hindawi Publishing Corporation, 2012, 2012, pp.1-5. ⟨10.1155/2012/893048⟩ ![]() |
||
hal-00823601v1
Article dans une revue
Computational identification of protein-coding sequences by comparative analysis International Journal of Data Mining and Bioinformatics, Inderscience, 2009, 3 (2), pp.160-76. ⟨10.1504/ijdmb.2009.024849⟩ |
||
inria-00281012v1
Article dans une revue
NORINE: a database of nonribosomal peptides. Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2008, Database issue, 36 (Database issue), pp.D326-31. ⟨10.1093/nar/gkm792⟩ |
||
hal-01090611v1
Article dans une revue
Prediction of New Bioactive Molecules using a Bayesian Belief Network Journal of Chemical Information and Modeling, American Chemical Society, 2014, 54 (1), pp.30-36. ⟨10.1021/ci4004909⟩ |
||
|