Une suite logicielle pour la protéomique interfacée sur une grille de calcul. Utilisation d'algorithmes libres pour l'identification MS/MS, le séquençage de novo et l'annotation fonctionnelle.

Christine Carapito (1) , Jérôme Pansanel (2) , Patrick Guterl (3) , Alexandre Burel (3) , Fabrice Bertile (3) , Stéphane Genaud (4) , Alain van Dorsselaer (3) , Christelle Roy (2)

1 LSMBO - Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique [Strasbourg]
2 DRS-IPHC - Département Recherches Subatomiques
3 DSA-IPHC - Département Sciences Analytiques et Interactions Ioniques et Biomoléculaires
4 LSIIT / ICPS - Laboratoire de Sciences de l'Image, de l'Informatique et de la Télédétection, équipe ICPS

Une suite logicielle pour la protéomique interfacée sur une grille de calcul. Utilisation d'algorithmes libres pour l'identification MS/MS, le séquençage de novo et l'annotation fonctionnelle.

Mots clés: Protéomique; Bioinformatique; Spectrométrie de masse; Annotations fonctionnelles; Séquençage de novo

Domaines: Calcul parallèle, distribué et partagé [cs.DC]

Christine Carapito, Jérôme Pansanel, Patrick Guterl, Alexandre Burel, Fabrice Bertile, et al.. Une suite logicielle pour la protéomique interfacée sur une grille de calcul. Utilisation d'algorithmes libres pour l'identification MS/MS, le séquençage de novo et l'annotation fonctionnelle.. Rencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France. ⟨hal-00653016⟩