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Références bibliographiques

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Mots-clés

Fork-join Cell wall Modelling DNA Biosensor Metabolism Automatic method Inducer Inverted repeat Metabolic engineering Amphibian Primer extension reactions Metabolic network Image segmentation Feature selection Copper complex Design Regulatory network Deregulation MapReduce Label similarity Polymer Physics DNA polymerases Neurodegenerative diseases LIQUID Inference Life Sciences Biosynthetic pathway RNA translational riboregulator Eukaryotic genome Retrosynthesis Attributes Selection Gene regulatory networks Post-transcriptional regulation Pathway regulation Mathematical morphology Modified triphosphates Qrt-pcr Multi-core DNA origami Phase-contrast microscopy Computer-aided design 450-DEGREES-C ISOTHERM Graph-based reconstruction Belief propagation Expérimentations in virtuo Peptidoglycan Biophysics Genes encode Hairpin structures Java concurrency Physique des polymères Modélisation 3D moléculaire EM algorithm DNA supercoiling Nonautonomous Regulators Coenzyme-a Data Reduction Molecular Biology Abasic nucleoside analogues In vitro synthetic biology LytM Gene regulation Systems Biology Aptamers Decision Trees Medical imaging Biosensors Biophysique Enzymatic synthesis Genetic Algorithms MicroRNAs Evolution Biosynthesis Microfluidics biochip Reference gene PHASE-DIAGRAM Peptidoglycan hydrolase Biochemistry Metal-mediated base pairs Development Protein Synthetic Biology Circuits AL-ZN SYSTEM Nucleoside triphosphate Cell-free protein synthesis Regulation Lac repressor RNAIII Drug delivery Metabolic pathway Synthetic biology Autolysin Monte-Carlo simulations Perylene bisimide Cancer systems biology Metabolomics LAYER

Bienvenue dans la collection des publications de l'Institut de Biologie Systémique et Synthétique

Présentation des activités

Le projet commun de l'iSSB vise à concevoir, construire et caractériser des circuits génétiques inédits insérés dans des bactéries, pour comprendre et contrôler la régulation génétique. Son domaine d’application future est la santé, notamment la synthèse contrôlée dans le temps de molécules thérapeutiques par des systèmes biologiques reprogrammés. Les recherches de l'iSSB combinent des approches théoriques, informatiques et expérimentales.

Thèmes de recherche

  • Approches de rétrosynthèse à l’interface chimie-biologie, appliquées à la production rationnelle de molécules d'intérêt chimique et thérapeutique par ingénierie métabolique.
  • Conception et synthèse de dispositifs régulateurs de l'expression génétique au niveau de la transcription et de la traduction ; développement d'une plateforme micro et milli-fluidique pour la validation et l'évolution in vivo des circuits de régulation synthétiques introduits dans des bactéries.
  • Étude de l’architecture des génomes et de son influence sur la régulation de l'expression des gènes. Une meilleure connaissance de l'organisation fonctionnelle des génomes est nécessaire à l'introduction rationnelle de circuits génétiques synthétiques dans les micro-organismes.
  • Élaboration d'outils permettant de synthétiser et répliquer des acides nucléiques artificiels (XNA) qui n'interfèrent pas avec les systèmes naturels. A terme, l'objectif est de fabriquer des micro-organismes utilisables par l'industrie, incapables de disséminer de l'information génétique vers les espèces naturelles ni d'en recevoir de ces dernières.