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Documents avec texte intégral

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Références bibliographiques

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Mots-clés

Cancer systems biology Chemistry DNA extraction Gene regulatory networks Retrosynthesis Biosynthesis Inducer Cell wall Copper complex Bacteria Genetic Algorithms DNA isotope labeling Protein Life Sciences Autolysin LIQUID DNA polymerases Genes encode Fermentation processes Amphibian Circuit Chemicals Decision Trees Synthetic biology DNA supercoiling Expérimentations in virtuo Metabolic engineering Fork-join Biotechnology Modelling Enzyme kinetics 450-DEGREES-C ISOTHERM Aptamers Circuits Genomics Automatic method Metabolism Mathematical morphology Computer-aided design AL-ZN SYSTEM Biophysics Analytical Attributes Selection LytM Drug delivery Biomanufacturing processes DNA replication Eukaryotic genome Design Gene regulation Label similarity BAC library Data Reduction Java concurrency Graph-based reconstruction DNA segregation EM algorithm Evolution Development Belief propagation Biochemistry Integrative biology Nucleoside triphosphate Systems Biology Inverted repeat DNA Molecular Biology Image segmentation Hippuric-acid Gaussian process regression Inference Biosynthetic pathways Biosensors Abasic nucleoside analogues Escherichia-coli In vitro synthetic biology Hairpin structures Cocaine Cell cycle LAYER Isotope-labeling Synthetic Biology Cancer-cells Feature selection Deregulation Enzyme screening Homeostasis Cell-free protein synthesis Asymmetry Lac repressor Biosynthetic pathway Dna replication Coenzyme-a Biophysique Enzymatic synthesis DNA origami Biosensor Isotope recombination MapReduce Heterogeneity

Bienvenue dans la collection des publications de l'Institut de Biologie Systémique et Synthétique

Présentation des activités

Le projet commun de l'iSSB vise à concevoir, construire et caractériser des circuits génétiques inédits insérés dans des bactéries, pour comprendre et contrôler la régulation génétique. Son domaine d’application future est la santé, notamment la synthèse contrôlée dans le temps de molécules thérapeutiques par des systèmes biologiques reprogrammés. Les recherches de l'iSSB combinent des approches théoriques, informatiques et expérimentales.

Thèmes de recherche

  • Approches de rétrosynthèse à l’interface chimie-biologie, appliquées à la production rationnelle de molécules d'intérêt chimique et thérapeutique par ingénierie métabolique.
  • Conception et synthèse de dispositifs régulateurs de l'expression génétique au niveau de la transcription et de la traduction ; développement d'une plateforme micro et milli-fluidique pour la validation et l'évolution in vivo des circuits de régulation synthétiques introduits dans des bactéries.
  • Étude de l’architecture des génomes et de son influence sur la régulation de l'expression des gènes. Une meilleure connaissance de l'organisation fonctionnelle des génomes est nécessaire à l'introduction rationnelle de circuits génétiques synthétiques dans les micro-organismes.
  • Élaboration d'outils permettant de synthétiser et répliquer des acides nucléiques artificiels (XNA) qui n'interfèrent pas avec les systèmes naturels. A terme, l'objectif est de fabriquer des micro-organismes utilisables par l'industrie, incapables de disséminer de l'information génétique vers les espèces naturelles ni d'en recevoir de ces dernières.

 

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