Present possibilities and future development of Clinical Proteomics

Présent et futur de la Protéomique clinique

Sylvain Lehmann (1, 2) , A. Dupuy (3) , K. Peoc'H (4) , Stephane Roche (1, 2) , B. Baudin (5) , J.-L. Beaudeux (6) , M. Quillard (7) , F. Berger (8) , G. Briand (9) , S. Chwetzoff (10) , G. Dine (11) , P. Gonzalo (12) , Stéphane Roche (13) , B. Dastugue (14) , M. Seve (15) , G. Siest (16)

1 IGH - Institut de génétique humaine
2 CHRU Montpellier - Hôpital Saint Eloi
3 CHU - Hôpital Lapeyronie [Montpellier]
4 Hôpital Lariboisière
5 CHU Saint-Antoine [AP-HP]
6 CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
7 CHU Rouen
8 Neurosciences précliniques
9 CHRU Lille - Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille]
10 Inflammation intestinale
11 Ecole Centrale Paris
12 BMSSI - Bases moléculaires et structurales des systèmes infectieux
13 CIC - Biotherapie - Lyon - Grenoble
14 Interactions génétiques et cellulaires au cours de la différenciation
15 CHUGA - Centre Hospitalier Universitaire [CHU Grenoble]
16 Génétique épidémiologique et moléculaire des pathologies cardiovasculaires

This review focuses on "clinical proteomics" which represents an emerging discipline in biomedical research. "Clinical proteomics" relies on the analysis of the proteome, i.e. the entire set of peptides and proteins present in a biological sample, to provide relevant data for diagnosis, prognosis or therapeutic strategies of human pathologies. This new type of approach has tremendous potential for the diagnosis of complex pathologies or for the early detection of cancers. This article reports the conclusions of a workgroup of the French Society for Clinical Biology (SFBC) 2004-2006 which evaluated the status, the impact and the future development of proteomics in the clinical field. It provides therefore a broad view going from the methods already present in the clinical laboratories (multiplex technologies...), to the tools for clinical and basis research including bioinformatics.

Cet article de synthèse se penche sur une nouvelle discipline biologique et médicale, la « protéomique clinique ». Cette approche « post-génomique » vise à utiliser l’étude du protéome, c’est-à-dire de l’ensemble des peptides et protéines présents dans un échantillon biologique, pour donner une information diagnostique, pronostique ou de suivi thérapeutique des pathologies humaines. Cette nouvelle discipline est en plein développement car elle présente d’importantes perspectives pour les pathologies complexes ou pour la détection précoce de pathologies telles que les cancers. Les éléments de cette revue résultent du travail d’un groupe thématique de la SFBC (Société française de biologie clinique) de 2004 à 2006 dont l’objectif était d’évaluer l’état actuel de la « protéomique clinique » et de s’interroger sur son développement et son application future pour les biologistes. Il s’agit donc d’un état des lieux assez large décrivant les approches déjà accessibles dans les laboratoires d’analyses biologiques (dosages multiplex…) et les outils disponibles en recherche clinique et en protéomique « fondamentale », sans oublier les aspects bio-informatiques nécessaires à l’utilisation des données générées.

Mots clés: proteomics; biomarker

Mots clés: multiplex; protéomique; biomarqueur

Domaines: Génétique humaine; Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]

Sylvain Lehmann, A. Dupuy, K. Peoc'H, Stephane Roche, B. Baudin, et al.. Présent et futur de la Protéomique clinique. Annales de Biologie Clinique, 2007, 65 (5), pp.463-471. ⟨10.1684/abc.2007.0149⟩. ⟨hal-00179241⟩